Генотипирование

Наборы реагентов для постановки специфических ПЦР для постановки ПЦР, ориентированных на STR-анализ, анализ микросателит, мультиплексный анализ, выявление мутаций, SNP, анализ на метилирование; содержат HotStarTaq Plus DNA Polymerase (модифицированная рекомбинантная ДНК полимераза из Th. aquaticus (94 кДа), клонированная в E. coli, для постановки стандартных ПЦР "горячий старт"), нуклеотиды, буферы и активные компоненты в формате мастер-микс (готовая валидированная смесь для проведения эффективной ПЦР).

Набор предназначен для определения аллелей А и В гена каппа-казеина крупного рогатого скота. Эти аллели являются маркерами молочной продуктивности коров и отличаются нуклеотидами, кодирующими аминокислотные остатки в 136 и 148 положениях в последовательности каппа-казеина, что влияет, в свою очередь, на термостабильность этого белка. Вариант А несёт треонин в 136 положении и аспарагиновую кислоту в 148 положении, вариант В - изолейцин и аланин, соответственно. Молоко, полученное от носителей аллеля В, характеризуется более высоким содержанием белка, способностью образовывать мицеллы меньшего размера, повышенной термостабильностью и считается более подходящим сырьём для производства творога и сыра.

Определение аллельного полиморфизма гена каппа-казеина производится методом анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (RFLP) — расщепления специфических ПЦР-продуктов эндонуклеазами рестрикции с последующим электрофоретическим разделением фрагментов, полученных в ходе рестрикции. В качестве матрицы для ПЦР используется геномная ДНК крупного рогатого скота.

Наборы для постановки ПЦР в реальном времени для ПЦР в реальном времени геномной, вирусной и комплиментарной ДНК, в том числе для анализа мРНК: QuantiTect - наборы для стандартной ПЦР на основе HotStarTaq рекомбинантной ДНК-полимеразы из Th. aquaticus (94 кДа), активирующейся в течение 15 мин при 95 °С); QuantiFast - наборы для высокоскоростной ПЦР на основе HotStarTaq Plus рекомбинантной ДНК-полимеразы, активирующейся в течение 5 мин при 95 °С).
Наборы содержат красители (опционально ROX, SYBRgreen), буферы, нуклеотиды и активные компоненты в формате мастер-микс (готовая валидированная смесь для проведения эффективной ПЦР в режиме реального времени с системами детекции SYBRgreen, TaqMan, FRET probes, Molecular Beacons); совместно с наборами QuantiTect возможно использование урацил-N-гликозилазы (для удаления ПЦР-продуктов, инактивируется при 95 °С в течение 15 мин).

Наборы реагентов для постановки специфических ПЦР для постановки ПЦР, ориентированных на STR-анализ, анализ микросателит, мультиплексный анализ, выявление мутаций, SNP, анализ на метилирование; содержат HotStarTaq Plus DNA Polymerase (модифицированная рекомбинантная ДНК полимераза из Th. aquaticus (94 кДа), клонированная в E. coli, для постановки стандартных ПЦР "горячий старт"), нуклеотиды, буферы и активные компоненты в формате мастер-микс (готовая валидированная смесь для проведения эффективной ПЦР).

Наборы реагентов для постановки специфических ПЦР для постановки ПЦР, ориентированных на STR-анализ, анализ микросателит, мультиплексный анализ, выявление мутаций, SNP, анализ на метилирование; содержат HotStarTaq Plus DNA Polymerase (модифицированная рекомбинантная ДНК полимераза из Th. aquaticus (94 кДа), клонированная в E. coli, для постановки стандартных ПЦР "горячий старт"), нуклеотиды, буферы и активные компоненты в формате мастер-микс (готовая валидированная смесь для проведения эффективной ПЦР).

Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.

Подготовка образцов

• Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
• для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
• исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
• одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².

Подготовка библиотеки

• Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
• получение результатов менее чем за 48 часов;
• библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.

Секвенирование

• Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
• наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
• поддерживается химия на 300 и 500 циклов.

Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN

• Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
• время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
• два независимых алгоритма генотипирования;
• 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
• сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
• глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.

Технические характеристики Набора Holotype HLA 24/7

• Набор Holotype HLA 24/7 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 24-луночный планшет для подготовки библиотеки;
• один набор рассчитан на анализ 24 образцов;
• типирование по 7 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DPB1, DQA1, DQB1 и DRB1);
• набор Holotype HLA 24/7 может быть выполнен в одной из 4-х конфигураций, A1, A2, A3, A4, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A1 стандартная идентификация от 1 до 24, в А2 – от 25 до 48, в А3 — от 49 до 72, в А4 — от 73 до 96. Совместное использование 4-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 96 образцов;
• ПО в комплекте;
• наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).

Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.

Подготовка образцов

• Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
• для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
• исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
• одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².

Подготовка библиотеки

• Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
• получение результатов менее чем за 48 часов;
• библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.

Секвенирование

• Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
• наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
• поддерживается химия на 300 и 500 циклов.

Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN

• Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
• время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
• два независимых алгоритма генотипирования;
• 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
• сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
• глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.

Технические характеристики Набора Holotype HLA 96/5

• Набор Holotype HLA 96/5 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 96-луночный планшет для подготовки библиотеки;
• один набор рассчитан на анализ 96 образцов;
• типирование по 5 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DRB1, DQB1);
• набор Holotype HLA 96/5 может быть выполнен в одной из 3-х конфигураций, A, B, C, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A стандартная идентификация от 1 до 96, в В — от 97 до 192, в С — от 193 до 288. Совместное использование 3-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 288 образцов;
• ПО в комплекте;
• наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).

Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.

Подготовка образцов

• Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
• для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
• исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
• одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².

Подготовка библиотеки

• Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
• получение результатов менее чем за 48 часов;
• библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.

Секвенирование

• Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
• наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
• поддерживается химия на 300 и 500 циклов.

Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN

• Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
• время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
• два независимых алгоритма генотипирования;
• 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
• сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
• глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.

Технические характеристики Набора Holotype HLA 96/7

• Набор Holotype HLA 96/7 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 96-луночный планшет для подготовки библиотеки;
• один набор рассчитан на анализ 96 образцов;
• типирование по 7 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DPB1, DQA1, DQB1 и DRB1);
• набор Holotype HLA 96/7 может быть выполнен в одной из 3-х конфигураций, A, B, C, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A стандартная идентификация от 1 до 96, в В — от 97 до 192, в С — от 193 до 288. Совместное использование 3-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 288 образцов;
• ПО в комплекте;
• наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).